Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL1Q5VZK9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL1Q5VZK9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms