Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms