Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HES3Q5TGS1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms