Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FGD3Q5JSP0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FGD3Q5JSP0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms