Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms