Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF4Q2M2E3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms