Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL24A1Q17RW2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL24A1Q17RW2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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