Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PFKFB4Q16877 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms