Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms