Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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