Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC85BQ15834 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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