Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms