Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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