Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EEA1Q15075 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms