Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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COL19A1Q14993 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL19A1Q14993 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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