Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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CHD4Q14839 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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