Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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