Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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COL9A2Q14055 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL9A2Q14055 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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