Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms