Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP1A4Q13733 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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