Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF5Q13568 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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