Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM28Q13263 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM28Q13263 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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