Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms