Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP4Q13115 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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