Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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