Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LCP2Q13094 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms