Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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