Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TROQ12816 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TROQ12816 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TROQ12816 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TROQ12816 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms