Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF5Q12774 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms