Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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