Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms