Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYP4F3Q08477 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms