Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOLGA3Q08378 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms