Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB2Q08289 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms