Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms