Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms