Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTDSPL2Q05D32 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms