Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A11Q02978 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms