Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCQ00610 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms