Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms