Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKL1Q00532 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms