Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFAMQ00059 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms