Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms