Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms