Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFC1P60507 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFC1P60507 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms