Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN15P56746 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms