Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC13P55735 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC13P55735 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms