Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIRAP54198 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIRAP54198 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms