Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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