Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms